上海动漫博物馆以“动漫、体验、科普”为核心，以科普性、互动性、趣味性为特色，内设历史展呈区、互动体验区、多功能３Ｄ影院、临展区等展区。一楼展示陈列区以回顾经典为主线，以漫画、动画发展长廊为表现载体；二楼动漫互动体验区通过基本技能的实践、前沿技术的展示、新媒体的互动使参观者全面参与漫画艺术创作，经历一场身临其境的梦幻体验；三楼剧场区拥有２００座的“立体影像、悬浮体验”３Ｄ电影院，为观众呈现多媒体视听盛宴。

　在落成典礼上，我国著名漫画大师、年逾九旬的方成作为上海建设漫画博物馆的倡议者，一次性向博物馆捐赠了近８０幅个人珍贵手稿。作为中国动画历史见证者的上海美术电影制片厂也为博物馆的建成倾注了极大心血。